19 мая 2006 года после детального анализа конкурсных заявок финалистов в ходе тайного голосования члены конкурсной комиссии выберут победителей, которые получат финансирование в объёме от 400 млн. до 1 млрд. рублей в 2006-2007 годах на реализацию своих инновационных образовательных программ. Общий объём финансирования образовательных программ победителей данного конкурса составит 10 млрд. рублей.
Список высших учебных заведений – финалистов конкурса:
- Алтайский государственный университет
- Воронежский государственный университет
- Государственный университет – Высшая школа экономики
- Дальневосточный государственный университет
- Кубанский государственный аграрный университет
- Мордовский государственный университет им. Огарева
- Московская медицинская академия им. Сеченова
- Московский авиационный институт
- Московский государственный институт стали и сплавов
- Московский государственный институт электронной техники
- Московский государственный технический университет им.Баумана
- Московский государственный университет им. Ломоносова
- Московский физико-технический институт (государственный университет)
- Нижегородский государственный университет им. Лобачевского
- Новосибирский государственный технический университет
- Новосибирский государственный университет
- Пермский государственный университет
- Российский государственный педагогический университет им.Герцена
- Российский государственный университет нефти и газа им.Губкина
- Самарский государственный аэрокосмический университет им. Королева
- Санкт-Петербургский государственный горный институт им. Плеханова
- Санкт-Петербургский государственный инженерно-экономический университет
- Санкт-Петербургский государственный университет
- Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет им. Ленина
- Таганрогский государственный радиотехнический университет
- Томский государственный университет
- Томский государственный университет систем управления и радиоэлектроники
- Томский политехнический университет